Вообще по всем этим вопросам рулит поиск. И очень сильно. В факе и инсталяциях эти вопросы достаточно подробно освещены.
от магнилолы тянется качественный провод (обязательно ли дорогой? и какое сечение брать?) в багажник к усилителю "+" и "-",
Питание уся идет от акума. От ГУ тянется межблок. И лучше хороший.

( уже можно провода подешевле? опять же какое сечение брать завтра на рынке?).
Подешевле - это за сколько? есть и 300 ре за метр, и 10... посеребренные 12 или 16 Га хватит. А так, да от усилка до кроса + и -

далее от кросовера идут на пищалки и мидбасы?
Именно.

где лучше всего разместить кросовер?
В гараже, на полке, и сделать поканалку ^_^
Без разницы. Можно в багажнике и от него тянуть. Тогда надо кучу проводов. Можно под торпедо спрятать - проводов надо меньше. Можно и в двери убрать. Но, если есть аттеньюатор, или как его там... тогда особо не попереключаешь.

имеет ли значение длина проводов до усилителя,
Ну, чем короче межблок, тем, вообще, лучше. Меньше шанс словить наводку.

от усилителя до кросовера, от кросовера до пищалок и мидбаса?
Не особо. Все равно длинна провода вообще будет одна и та же, в общем. Но я бы крос прятал поближе к колонкам.

а потом на колонки и штатного вполне хватит, тот что в комплекте поставляеться
Если только заразился звуком, то пока хватит. Если будешь болеть дальше, все равно все (вообще все в системе) заменишь, минимум один раз. А если выздоровишь - тем более без разницы.