Сам лично магнитолу не щупал. Пишут что читает divX 720x480, fps 25-30 битрейт хз. Еще пишут что AVI читает. Ясно понятно что всякие BDripы и прочие 10-15 гиговые фильмы фуллХД не съест он). Флешка на сколько у вас? Файловая система на флешке fat/ntfs?

Конверторы: я эти пользуюсь Xilisoft Video Converter Ultimate
Либо онлайн конвертеры типа этого

После прочтения съесть!