Что еще имеется в системе? Фронт заменен и играет через усилитель? или фронт штатный от штатной головы и кикс будет единственным усем?
Хотя тут в любом случае, если генератор и сгорит, то никак не от уся, падение напряжения будет если только на заглушенной машине слушать.
Меньше слушайте тех, кто говорит про конденсатор, он нужен чтобы девок завлекать (и то если на нем есть мигающие циферки). Гель тут тоже не нужен.
Все что Вам нужно это качественное питание. А если быть точным, то:
Кабель АКБ - усь (т.к. АКБ в багажнике, то имеет смысл взять с него и плюс и минус) - пойдет обычный сварочный кабель КГ25 (Кабель гибкий 25 кв.мм.) и предохранитель на него ампер на 100-125 вот по этой таблице Таблица сечений кабеля, предохранителей
Так же поставить кабель не меньшего сечения АКБ-Кузов
С генератором незнаю как быть, нету смысля тянуть к АКБ усиленный, но вот усилить минус на кузов, думаю имеет смысл, надо по месту смотреть.
Вообще почитайте вот этот раздел: http://magnitola.org/o-kommutacii/
Ну еще не забывайте, что на усилитель нужен Remote (управляющий провод с магнитолы, обычно сине-белый, на штатке незнаю какой) чтобы включался только тогда, когда включена магнитола.

Так же можете поискать инсталлы с Вашим авто в "Наших инсталляциях", там точно были такие и на примерах наглядных, с картинками уже все рассмотреть.