Отбросив мистику, на треке 3 минуты 35 секунд все-таки убедился, что даунсемплинг к 44100 Гц имеет место, делает это Андроид, и не случайным образом, как показалось ранее. Но принимающая сторона об этом не догадывается:
Нажмите на изображение для увеличения
Название: Снимок экрана от 2015-12-10 02-27-53.png
Просмотров: 0
Размер:	114.7 Кб
ID:	909832
(48000-44100)*(3*60+35)=838.500 сэмплов .

Придется выяснять не только как и зачем, но и какому формату приводится передача по S/PDIF в конечном счете.
Запись слишком много занимает даже в архиве, поэтому не выкладывается.