У штатных динамиков уже есть кроссовер 1-го порядка - это конденсатор включенный последовательно с пищалкой, так что спокойно подключай выходы усилителя магнитолы к динамикам. Правда соблюдая полярность, а с этим не всегда бывает просто определится так как она своеобразна отмечена в штатной проводке автомобиля
Так как у ГУ будет задействован усилитель то будет необходимо обеспечить ему нормальное питание, а штатная проводка для этого плохо предусмотрена, поэтому рекомендую протянуть провода питания к ГУ от аккумулятора (не забыв про предохранитель).
К активному сабу так же нужно будет протянуть провода питания от аккумулятора и линейный выход с ГУ. Если есть отдельный выход на сабвуфер то можно и его. Опять же не забывая про предохранитель который должен находится не далее 40 см от аккумулятора.