Стоит ли делать корпуса с фазоинвертором?
Слушать надо, это на любителя.Хочешь что б "придавливало в машине" -ф.и. (я люблю ф.и.) что бы тише, но правильно играло- з.я. Данные динамики и там и там играть будут.Я за ФИ-но это ИМХО

Круглый или щелевой фаз?-
тоже на любителя.Вэтом вопросе не силен, как я понимаю щелевый точнее играет (есть точные настройки от произовдителя) -щелевый более сложный вариант, но звуковое дваление слинее можно получить и бас глубже.Поправте если не прав.

Правильное расположение головок в багажнике?-

Все вопросы на дело вкуса, у тебя Поэтому ответы такие же. Вправильное располжение в сторону багажника, но у меня все сабы направленны в спкигнку заднего сиденья.Если у тебя хэтчбэек то однозначно в сторону багажника или два стелса в бока

Общий или раздельный корпус для двух головок?

Лучше раздельный- более грамотно и четко все легче сделать и расчитать.