В идеале источник питания необходимо устанавливать рядом с усилителем. В вашем случае необходимо рассчитать сечение провода исходя из потребления тока вашими потребителями (усилителями) и длинны проводника. В силовой схемотехнике всегда принято распределять нагрузку звездой (с одной точки). А вообще для независимого питания ставят по мощнее генератор, который заряжает и штатный аккумулятор и аккумулятор для аудиосистемы. При помощи специального диодного моста происходит отсечка питания, т.е когда мы глушим двигатель - разрежается только акум. отвечающий за аудиосистему. Обычно эти акумы и ставят в багажник рядышком с усем. Да и про силовой кондёр не забудьте, если для вас важна динамика и быстрый отклик усилителя.